グリーンジャンボ宝くじの特別賞として、「緑のナンバーズゲーム」という形で当選した人のみ挑戦ができる追加賞として作られたのが日本の数字選択式宝くじの発祥とされています。当時は特別賞の一環であったため、数字は3桁であり、すべて一致、順番違い、1字違いの3つの区分で賞金が設定されていました。
1990年には、国際花と緑の博覧会の会場内で、ナンバーズゲームくじが発売されます。1994年10月1日にはナンバーズ3とナンバーズ4の発売開始し、7日にナンバーズ3とナンバーズ4の最初の抽せんが行われます。当初は毎週1回、金曜日に抽せんが行われていました。
1995年1月10日には、火曜日にもナンバーズ3とナンバーズ4の抽せんが行われるようになります。
平成6年l0月から地域を限定（宮城県、福島県、岡山県、広島県）して発売を始め、7年4月から全国で発売されました。ナンバーズには購入者が自分で数字を選択することができる宝くじで、3ケタの数字を申し込む「ナンバーズ3（スリー）」と、4ケタの数字を申し込む「ナンバーズ4（フォー）」の2種類があります。価格は1口あたり200円、全国約11,000ヵ所あります。